现代的中医学普遍认为沉香在行气止痛，降逆调中，温肾纳气上较有功效。据《本草备要》中记载：沉香性温，诸木皆浮，而沉香独沉，故能下气而堕痰涎，能降亦能升。怒则气上，能平则下气。香入脾，故能理诸气而调中。其色黑，体阳，故入右肾命门，暖精助阳。行气不伤气，温中不助火。
在韩国及日本，树脂含量超过25%的沉香(即沉水沉香)才能用来下药；在中国，标准为15%。沉香组成的复方亦多，服用量随病情而有所差异。一般而言，一天服用量以0.1~ 0.3g为宜。沉香含挥发油，不宜入煎剂，煎煮后油脂（树脂）丧失而无效。宜研末冲服，以保存油脂。若要煎汤，须以特殊方法煎之。
《本草备要》曾有记载沉香，目前出版的《中国药典》中也有相当多的以沉香为主味的中成药方。相比西医，中医更为认可沉香的养生功效。
上海中医药大学附属曙光医院传统中医科主任医师认为，沉香与檀香一样，属于一种香药，沉香除了品香外，还可以内服、外洗。介绍说，与其他的香药不同的是，沉香的香气沉重，有下行的作用，沉香作为一种中药材，具有芳香开窍、疏经通络、降气、解毒等作用，在临床上经常用于脘腹胀痛、跌打损伤等，如治疗咳嗽、胃胀气、打嗝、关节病、颈椎病、腰腿酸软，以及中风、脑血管意外等。除了内服，还可以用于外洗、燃烧。
上海中医药大学中医特色诊疗研究所所长认为，沉香最早是从非洲、中东等地传入我国。作为一种香料，沉香在中药中主要起到走串、通行、止痛的作用，可用于治疗心血管、冠心病、心梗、椎间盘突出症的止痛等。
中药讲究气、味，沉香除了用于内服，沉香燃烧的香气可以通过鼻孔、汗毛孔吸收，因此熏香在具有一种愉悦感的同时，也具有一定的养生功效。
中国大陆所产的沉香，在中国医药学中记载颇多。
功效：行气止痛，温中止呕，纳气平喘。用于胸腹胀闷疼痛，胃寒呕吐呃逆，肾虚气逆喘急。性味与归经：辛苦，温。①《别录》：微温。②《海药本草》：味苦，温，无毒。③《日华子本草》：味辛，热，无毒。④《纲目》：咀嚼香甜者性平，辛辣者性热。入肾、脾、胃经。
①《雷公炮制药性解》:肾、命门二经。②《本草经疏》:入足阳明、太阴、少阴，兼入手少阴、足厥阴经。③《药品化义》：入肺、肾二经。④《本草经解》:足少阳胆经、足厥阴肝经、手太阴肺经。治气逆喘息，呕吐呃逆，脘腹胀痛，腰膝虚冷，大肠虚秘，小便气淋，男子精冷。
①《别录》：疗风水毒肿，去恶气。②陶弘景：疗恶核毒肿。③《海药本草》：主心腹痛、霍乱、中恶，清神，并宜酒煮服之；诸疮肿宜入膏用。④《日华子本草》：调中，补五脏，益精壮阳，暖腰膝，去邪气。止转筋、吐泻、冷气，破症癖，（治）冷风麻痹，骨节不任，湿风皮肤痒，心腹痛，气痢。⑤《珍珠囊》：补肾，又能去恶气，调中。⑥《纲目》：治上热下寒，气逆喘息，大肠虚闭，小便气淋，男子精冷。⑦《医林纂要》：坚肾，补命门，温中、燥脾湿，泻心、降逆气，凡一切不调之气皆能调之。并治噤口毒痢及邪恶冷风寒痹。⑧《本草再新》：治肝郁，降肝气，和脾胃，消湿气，利水开窍。
